Index

A

ACSF (class in AtomicAI.descriptors.acsf) ACSF_Force (class in AtomicAI.descriptors.acsf) analyze_vectors() (in module AtomicAI.tools.build_multilayers) AtomicAI.descriptors.acsf module AtomicAI.descriptors.calculate_descriptors module AtomicAI.descriptors.generate_force_descriptor module AtomicAI.descriptors.laaf module AtomicAI.descriptors.mbsf module AtomicAI.dim_reduction.lpp module AtomicAI.dim_reduction.tslpp module

AtomicAI.mlff.LassoLarCV module AtomicAI.mlff.mlff module AtomicAI.tools.build_multilayers module AtomicAI.tools.rdf module AtomicAI.tools.select_snapshots module AtomicAI.tools.structure_analysis module AtomicAI.tools.supercell module AtomicAI.tools.surfaces module available_pairs() (in module AtomicAI.tools.rdf) AverageFingerprintCalculator (class in AtomicAI.descriptors.laaf)

B

build_multilayer() (in module AtomicAI.tools.build_multilayers)

build_multilayers() (in module AtomicAI.tools.build_multilayers)

C

calculate_average_fingerprint() (in module AtomicAI.descriptors.laaf) calculate_descriptors() (in module AtomicAI.descriptors.calculate_descriptors) calculate_eta() (in module AtomicAI.descriptors.laaf) calculate_fingerprint_vector() (in module AtomicAI.descriptors.laaf) calculate_mirror_cubic() (in module AtomicAI.descriptors.acsf) (in module AtomicAI.descriptors.mbsf) calculate_stack_position() (in module AtomicAI.tools.build_multilayers)

compute_averaged_fingeprints_selection() (AtomicAI.descriptors.laaf.AverageFingerprintCalculator method) compute_averaged_fingerprints_random() (AtomicAI.descriptors.laaf.AverageFingerprintCalculator method) compute_lpp() (in module AtomicAI.dim_reduction.lpp) (in module AtomicAI.dim_reduction.tslpp) create() (AtomicAI.descriptors.acsf.ACSF method) (AtomicAI.descriptors.acsf.ACSF_Force method) (AtomicAI.descriptors.mbsf.MBSF method) create_supercell() (in module AtomicAI.tools.build_multilayers)

F

force_descriptor() (in module AtomicAI.descriptors.generate_force_descriptor)

G

generate_force_descriptors() (in module AtomicAI.descriptors.generate_force_descriptor) generate_supercell_vasp() (in module AtomicAI.tools.supercell) get_g2() (in module AtomicAI.descriptors.acsf) get_g3() (in module AtomicAI.descriptors.acsf) get_g4() (in module AtomicAI.descriptors.acsf) get_g5() (in module AtomicAI.descriptors.acsf) get_ga_nblst() (in module AtomicAI.descriptors.mbsf) get_gr() (in module AtomicAI.descriptors.mbsf)

get_gr_nblst() (in module AtomicAI.descriptors.mbsf) get_grga() (in module AtomicAI.descriptors.mbsf) get_mlff() (in module AtomicAI.mlff.mlff) get_multiples_mapping() (in module AtomicAI.tools.build_multilayers) get_neighbour_lst() (in module AtomicAI.descriptors.mbsf) get_nonredundant_permutations() (in module AtomicAI.tools.build_multilayers) get_v2b() (in module AtomicAI.descriptors.acsf) get_v3b() (in module AtomicAI.descriptors.acsf)

L

lpp() (in module AtomicAI.dim_reduction.lpp)

M

MBSF (class in AtomicAI.descriptors.mbsf) module AtomicAI.descriptors.acsf AtomicAI.descriptors.calculate_descriptors AtomicAI.descriptors.generate_force_descriptor AtomicAI.descriptors.laaf AtomicAI.descriptors.mbsf AtomicAI.dim_reduction.lpp AtomicAI.dim_reduction.tslpp AtomicAI.mlff.LassoLarCV AtomicAI.mlff.mlff AtomicAI.tools.build_multilayers AtomicAI.tools.rdf AtomicAI.tools.select_snapshots AtomicAI.tools.structure_analysis AtomicAI.tools.supercell AtomicAI.tools.surfaces

moving_average() (in module AtomicAI.tools.rdf)

N

new_centering() (in module AtomicAI.dim_reduction.lpp) (in module AtomicAI.dim_reduction.tslpp)

P

pairs() (in module AtomicAI.tools.rdf) perform_lpp() (in module AtomicAI.dim_reduction.lpp) (in module AtomicAI.dim_reduction.tslpp)

predict_pairs() (in module AtomicAI.tools.rdf) prepare_vforce() (in module AtomicAI.descriptors.generate_force_descriptor) print_results() (in module AtomicAI.tools.build_multilayers)

R

random_vforce() (in module AtomicAI.descriptors.acsf)

RDF() (in module AtomicAI.tools.rdf) read_vasp_files() (in module AtomicAI.tools.build_multilayers)

S

select_snapshots() (in module AtomicAI.tools.select_snapshots) set_eta() (in module AtomicAI.descriptors.acsf) setup_logging() (in module AtomicAI.tools.build_multilayers) structure_analysis() (in module AtomicAI.tools.structure_analysis)

structures() (in module AtomicAI.tools.surfaces) supercell() (in module AtomicAI.tools.rdf) (in module AtomicAI.tools.supercell) surfaces() (in module AtomicAI.tools.surfaces)

T

tslpp() (in module AtomicAI.dim_reduction.tslpp)

W

writeout_fp() (in module AtomicAI.descriptors.generate_force_descriptor)